Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot6Q8K3P5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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