Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Prpf39Q8K2Z2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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