Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Neurl3Q8CJC5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms