Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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