Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms