Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms