Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc17Q8CE13 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc17Q8CE13 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc17Q8CE13 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc17Q8CE13 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc17Q8CE13 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc17Q8CE13 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc17Q8CE13 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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