Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc27Q8CD92 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms