Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms