Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E4f1Q8CCE9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms