Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Slfn5Q8CBA2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slfn5Q8CBA2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Slfn5Q8CBA2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Slfn5Q8CBA2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Slfn5Q8CBA2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Slfn5Q8CBA2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Slfn5Q8CBA2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slfn5Q8CBA2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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