Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms