Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsr2Q8C8T8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsr2Q8C8T8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms