Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q8C708 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q8C708 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Q8C708 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Q8C708 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q8C708 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Q8C708 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q8C708 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q8C708 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms