Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms