Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Strip1Q8C079 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms