Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm42897-201ENSMUST00000201486 2112 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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