Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ctdsp2Q8BX07 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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