Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp38Q8BW70 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp38Q8BW70 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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