Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Triml1Q8BVP1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms