Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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