Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms