Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms