Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms