Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms