Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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