Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms