Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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H2-M10.6Q85ZW5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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H2-M10.6Q85ZW5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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H2-M10.6Q85ZW5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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H2-M10.6Q85ZW5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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