Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms