Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39bQ810L4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem39bQ810L4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms