Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms