Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zbed4Q80WQ9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zbed4Q80WQ9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zbed4Q80WQ9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zbed4Q80WQ9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zbed4Q80WQ9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zbed4Q80WQ9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zbed4Q80WQ9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zbed4Q80WQ9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms