Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc29Q80VM3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc29Q80VM3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc29Q80VM3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc29Q80VM3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc29Q80VM3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc29Q80VM3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc29Q80VM3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc29Q80VM3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc29Q80VM3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ttc29Q80VM3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc29Q80VM3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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