Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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