Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
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