Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ckap2lQ7TS74 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ckap2lQ7TS74 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms