Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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