Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rtn4rl2Q7M6Z0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rtn4rl2Q7M6Z0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rtn4rl2Q7M6Z0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rtn4rl2Q7M6Z0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rtn4rl2Q7M6Z0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rtn4rl2Q7M6Z0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms