Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms