Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Higd1cQ76I25 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms