Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rph3alQ768S4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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