Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cspg5Q71M36 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cspg5Q71M36 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cspg5Q71M36 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cspg5Q71M36 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cspg5Q71M36 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cspg5Q71M36 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cspg5Q71M36 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cspg5Q71M36 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cspg5Q71M36 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cspg5Q71M36 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cspg5Q71M36 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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