Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv1Q704Y3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trpv1Q704Y3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms