Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssx9Q6XAS3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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