Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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