Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms