Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Senp6Q6P7W0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Senp6Q6P7W0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Senp6Q6P7W0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Senp6Q6P7W0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Senp6Q6P7W0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Senp6Q6P7W0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms