Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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