Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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