Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tpm4Q6IRU2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tpm4Q6IRU2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tpm4Q6IRU2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tpm4Q6IRU2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tpm4Q6IRU2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tpm4Q6IRU2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tpm4Q6IRU2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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